Aspect mycologie

[J Gravier]

Bonjour à tous,

j'ai trouvé ça, publication 2015 :

"L'objectif de l'étude de génomique comparative publiée dans Nature Genetics et conduite par le consortium Mycorrhizal Genomics Initiative, coordonné par l'Inra, visait à identifier les processus évolutifs qui ont conduit à l’apparition des champignons mycorhiziens dans toutes les forêts du globe il y a plus de 200 millions d'années. Pour cela, les chercheurs ont séquencé et analysé 13 nouveaux génomes de symbiotes mycorhiziens dont ceux de l'amanite tue-mouche, du bolet jaune et du paxille enroulé. Ils les ont comparés aux génomes des champignons mycorhiziens déjà séquencés, Laccaria bicolor, la Truffe noire du Périgord et le champignon à arbuscules, Rhizophagus irregularis, ainsi qu'à 33 génomes de champignons décomposeurs. Les chercheurs ont caractérisé l’arsenal de dégradation enzymatique de ces champignons et en particulier les différentes familles de gènes impliqués dans la dégradation du composant majeur du bois, la lignocellulose.

Cette analyse phylogénomique met en évidence une forte corrélation entre le répertoire de gènes impliqués dans la décomposition de la lignocellulose (cellulases, ligninases) et les styles de vie (pourriture blanche, pourriture brune ou symbiote mycorhizien). Elle révèle également que la symbiose mycorhizienne est apparue indépendamment dans toutes les lignées principales des champignons par convergence évolutive soulignant ainsi son succès évolutif.

Sur la base de ces travaux originaux, les chercheurs proposent un scénario expliquant l’évolution des principaux groupes de champignons forestiers au cours des dernières 300 millions d’années. Les premiers champignons xylophages auraient été des agents de la pourriture blanche équipés d’un arsenal important d’enzymes de dégradation de la lignine et de la cellulose . Ces espèces ancestrales auraient ensuite évolué vers les agents de la pourriture brune capables de dépolymériser la lignine par des réactions chimiques d’oxydo-réduction et de consommer ensuite la cellulose. Enfin, des pourritures blanches ou brunes auraient établi des mécanismes de communication afin de dialoguer avec les racines des arbres et établir ainsi des relations symbiotiques avec elles. Ces nouvelles espèces mutualistes auraient ainsi été capables d'utiliser les sucres simples de leur hôte et se seraient débarrassé de leur coûteux arsenal de dégradation enzymatique par érosion génomique. Outre la réduction massive des enzymes de dégradation de la paroi végétale, il apparaît que la capacité à former une symbiose mycorhizienne impose également l’invention de protéines de communication capables de contrôler les défenses immunitaires de la plante, condition indispensable à la colonisastion massive de la racine.

Ces travaux apportent un éclairage nouveau sur l'histoire évolutive de deux guildes majeures de champignons forestiers, les décomposeurs et les symbiotes mutualistes. Ils mettent également en évidence la relation forte entre la composition de l'arsenal enzymatique de dégradation et la niche écologique des champignons forestiers. Enfin, les ressources génomiques générées par ce programme faciliteront les études fonctionnelles sur l'impact des changements globaux sur les services écosystémiques assurés par ces champignons du sol.

Référence

Annegret Kohler, Alan Kuo, Laszlo G Nagy, Emmanuelle Morin, Kerrie W Barry, Francois Buscot, Björn Canbäck, Cindy Choi, Nicolas Cichocki, Alicia Clum, Jan Colpaert, Alex Copeland, Mauricio D Costa, Jeanne Doré, Dimitrios Floudas, Gilles Gay, Mariangela Girlanda, Bernard Henrissat, Sylvie Herrmann, Jaqueline Hess, Nils Högberg, Tomas Johansson, Hassine-Radhouane Khouja, Kurt LaButti, Urs Lahrmann, Anthony Levasseur, Erika A Lindquist, Anna Lipzen, Roland Marmeisse, Elena Martino, Claude Murat, Chew Y Ngan, Uwe Nehls, Jonathan M Plett, Anne Pringle, Robin A Ohm, Silvia Perotto, Robert Riley, Francois Rineau, Joske Ruytinx, Asaf Salamov, Firoz Shah, Hui Sun, Mika Tarkka, Andrew Tritt, Claire Veneault-Fourrey, Alga Zuccaro, Mycorrhizal Genomics Initiative Consortium, Anders Tunlid, Igor V Grigoriev, David S Hibbett & Francis Martin. Convergent losses of decay mechanisms and rapid turnover of symbiosis genes in mycorrhizal mutualists. Nature Genetics, en ligne le 23 février 2015. doi:10.1038/ng.3223

[mycomyco]

Merci pour ces informations, il s'agit d'un travail préliminaire effectuer.
ce travail est actuellement encore en cours par le biais de différents projets dont un sur lesquels je travail avec eux.

[jjr24]

Bonjour,

Merci Joël pour cet article! de mémoire, j'avais lu que les arbres pouvaient "baisser" leurs défenses, par reconnaissance de ces communications;
Bon dimanche.JJR24

[bernard]

Nooooooooon, pas toi Bernard.....

L'orthographe: pisolithe

Bonne continuation

Joel

Joël tu es sévère avec moi Je n'ai fait qu'un copier-coller, mais grâce à ta correction j'ai trouvé ceci :


Truffes corses

Comment se nomment les truffes corses de couleur jaune moucheté à l’intérieur ?

lundi 19 juillet 2004



Ce que les Corses appellent « truffes de Corse » et qu’ils mangent, c’est en fait du pisolithe (Pisolithus tinctorius), basidiomycète ectomycorhizien se développant sur sol sableux et acide, sous pins, cistes, eucalyptus, chênes .. Le pisolithe ressemble à une vesse de loup . Il est utilisé pour l’inoculation de plants forestiers pour les pays chauds . J’en ai eu entre les mains en provenance de Corse . Il n’est comestible qu’à l’ état jeune . A l’état adulte , il est plein de spores qui forme une poudre non comestible.

Gérard Chevalier

[mycomyco]

Bonjour,

Merci Joël pour cet article! de mémoire, j'avais lu que les arbres pouvaient "baisser" leurs défenses, par reconnaissance de ces communications;
Bon dimanche.JJR24

Exact on a prouver ce phénomène avec les acacias en Afrique

[rabase]

Pour en trouver de pas mure rien d'évident en fait quand on peut les voir pour moi du moins ils sont déjà murs

[rabase]

Rectification quand on les coupes en deux aspect jaune or noir pas forcément appétissant mais très joli

[J Gravier]

je suis un peu taquin, oui Bernard, j'avais eu le même soucis que toi quand j'avais fait une recherche sur le net il y a deux ou trois ans.... et je m'en suis souvenu.... pour m'en sortir j'avais tapé "pysolite champignon" et Google avait été sympa avec moi.... j'ai enfin trouvé "pisolithe"

joel

[bernard]

Rassures toi Joël, j'avais très compris que tu me taquinais et je t'ai fait croire que j'en étais frustré, il n'en est rien, il m'en faut un peu plus.

[jacques 37]

j'avais tapé "pysolite champignon" et Google avait été sympa avec moi.... j'ai enfin trouvé "pisolithe"

joel

Bernard ne sois pas honteux, j'avoue également être tombé dans ce piège orthographique lorsque nous avions abordé ce champignon dans nos échanges ....

[OLIVE81]

bonjour olive pour la derniere foto , tu est a quel grossissement j-j

Voilà Gilou la réponse à ta question :

Pour la dernière photo : oculaire x10, objectif x100 à immersion ce qui nous fait un grossissement x1000. La caméra n'y change rien elle est réglée pour conserver l'échelle 1:1. Ensuite il faut ajouter un peu de retouche d'image pour retrouver les couleurs d'origine.

En espérant que ça te détendra. Bien cordialement

Olive

[rabase]

Très beau ton kaléidoscope si tu peux indiquer les associations

[arcadius]

bonsoir trufalou

c est des très belles photos , des mycorhizes de châtaigniers dans le lot de photos ,alors la tu m intéresses trufalou...

truffadoux

[max26]

C'est beau ça!!!!

[Jcrtruffe]

Bonjour trufalou

Le châtaignier ne pousse pas dans les terrains calcaires et aime les terrains argileux avec pH acide.

Donc les mychorizes en photo ne doivent pas être de truffe mais d'autres champignons .

Lequel ? Si tu peux m'éclairer ?

Cdlt. Jcr